miRDB数据库有什么用
这篇文章主要介绍miRDB数据库有什么用，文中介绍的非常详细，具有一定的参考价值，感兴趣的小伙伴们一定要看完！
创新互联是一家专注于成都网站设计、成都网站建设与策划设计,乐东黎族网站建设哪家好?创新互联做网站,专注于网站建设10余年,网设计领域的专业建站公司;建站业务涵盖:乐东黎族等地区。乐东黎族做网站价格咨询:18982081108
miRDB通过MirTarget这个软件预测了人，小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息，并将其整理成了数据库，网址如下
http://www.mirdb.org/
该数据库中涵盖的物种如下
huaman
mouse
rat
dog
chicken
每个物种相关的miRNA和靶基因数量统计如下
除了提供软件预测的靶基因结果外，该数据库还做了一个文献整理的工作，将报导了miRNA前体或者成熟miRNA功能的相关文献收集整理，汇总形成了一个miRNA功能数据库，称之为FuncMir, 该数据库包含了人和小鼠这两个物种中的miRNA信息，示意如下
点击红色链接可以查看详细信息和相关的pubmed文献。
官网提供了两种检索功能
1. target search
该功能一次只可以检索一个miRNA后者gene, 检索框如下所示
2. target mining
该功能用于一次检索多个miRNA或者gene,检索框如下所示
检索结果如下所示
结果会按照TarGetScore进行排序，由于是软件预测的结果，score值越高，可信度也越高。通常认为score大于80的结果是相对可靠的，而低于60的话可信度就很差了。
该数据库提供了下载功能，可以方便的下载数据库中的所有信息，示意如下
miRDB本质上是一个软件预测的miRNA靶基因数据库，如果只看这一个数据库，结果的假阳性率会比较高，最好的做法是结合多个软件预测或者数据库的结果，类似miRWalk数据库的思路，来弥补单一软件算法的不足之处。
以上是“miRDB数据库有什么用”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！希望分享的内容对大家有帮助，更多相关知识，欢迎关注创新互联行业资讯频道！
新闻名称：miRDB数据库有什么用
文章源于：http://cdiso.cn/article/poggis.html
